GeneChip™アレイ

理研ジェネシスは、Affymetrix Japan社の公認プロバイダとして各種GeneChip™受託解析に必要な設備や解析ソフトを備え、トレーニングを十分に積んだ経験豊富なDNAマイクロアレイ実験のスペシャリストが解析を行い、お客様に高品質で再現性や信頼性の高い、最高水準のデータを提供しております。


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概要


Affy
GeneChipアレイは、フォトリソグラフィーとコンビナトリアル・ケミストリーを組み合わせたオートメーション製造プロセスにより作製されています。また、ハイブリダイゼーション以降の操作が自動化されているため、作業に由来するチップ間のデータのばらつきが最小限に抑えられ、再現性の高い解析が可能です。発現解析用の GeneChip™アレイは、 3'IVT Array と、 Gene Arrayおよび Exon Array に分けられます。3'IVT Array は、遺伝子の3'末端側にプローブが設計されています。Gene Array や ExonArray は転写産物全長にわたってプローブが設計されています。

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各アレイの特徴

対応生物種
ヒト、マウス、ラット、ショウジョウバエ、シロイヌナズナ、線虫、酵母、イヌ、など多数
Test Array, CustomExpress™ Array のご利用も承ります。
アレイの仕様
オリゴヌクレオチドプローブ長 … 25 mer
Probe selection region のプローブ数 … 11 ~ 20 / region
プローブペア … Perfect match (PM) + Mismatch (MM)
代表的なアレイ
・Human Genome U133 Plus 2.0 Array … 47,400 transcripts
・Mouse Genome 430 2.0 Array … 39,000 transcripts
・Rat Genome 230 2.0 Array … 30,000 transcripts
アッセイ手法
GeneChip™ 3' IVT PLUS Kit を用いたcRNA 増幅(真核生物)
GeneChip™ Hybridization, Wash and Stain Kit
必要サンプル量
真核生物用 … total RNA 300 ng 以上(濃度50 ng/μl 以上)
対応生物種
ヒト、マウス、ラット、他のモデル生物など多数
アレイの仕様
オリゴヌクレオチドプローブ長 … 25 mer
Probe selection region のプローブ数 …21 ~ 27 / gene
プローブセット … Perfect match (PM)
代表的なアレイ
・Human Gene 2.0 ST Array … 40,716 transcripts
・Mouse Gene 2.0 ST Array … 35,240 transcripts
・Rat Gene 2.0 ST Array … 28,407 transcripts
アッセイ手法
WT Expression Kit, GeneChip™ WT terminal Labeling Kit
GeneChip™ Hybridization, Wash and Stain Kit
必要サンプル量
total RNA 300 ng 以上(濃度50 ng/μl 以上)
対応生物種
ヒト、マウス、ラット
アレイの仕様
オリゴヌクレオチドプローブ長 … 25 mer
Probe selection region のプローブ数 … 4 / exon
プローブセット … Perfect match (PM)
代表的なアレイ
・Human Exon 1.0 ST Array … 140 万probe
・Mouse Exon 1.0 ST Array … 120 万probe
・Rat Exon 1.0 ST Array … 100 万probe
アッセイ手法
WT Expression Kit, GeneChip™ WT terminal Labeling Kit
GeneChip™ Hybridization, Wash and Stain Kit
必要サンプル量
total RNA 300 ng 以上(濃度50 ng/μl 以上)
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