小家系連鎖解析

概要


ジェノタイピングチップで観測されたSNPデータを用いて、家系情報と罹患情報をもとにパラメトリック連鎖解析を実施します。算出されたLODスコアから関連候補領域を抽出し、平均LODスコアを記録したBEDファイルを作成します。また、各染色体のLODスコアの分布図も描画します。
※ Exome解析で得られた候補変異リストの絞り込み用にご利用ください。

特徴

  • 小規模の家系情報と罹患情報(※1)を利用し、SNPジェノタイピングを用いて解析を行います。
  • Exome解析と組み合わせることによって、関連候補領域の絞り込みを効率的に行うことができます。
  • 優性様式、劣性様式、傾向性様式の3つの様式のもとで解析を行います。
  • 各染色体のLODスコア分布図と関連候補領域を示したBEDファイルを作成します。
  • 事前に統計的研究デザインを行うことにより、候補領域の絞り込みの可能性を評価することができます。
  • Exome解析との統合も承っております。

(※1) 1つの質的形質で20個体までの小家系データを対象とした解析です。この範囲であれば家系数の制限はありません。

サンプル条件 (詳しくは、ご相談下さい)

サービス内容

  1. お預かりしたDNAサンプルの品質を確認します。
  2. ジェノタイピング解析を行います。
  3. ジェノタイピング解析で得られたデータの集計を行います。
  4. 家系情報をもちいて候補領域の抽出を行います。

※ Exome解析のアノテーションに連鎖解析結果を追加します。
 (オプション)

納品物

  1. ジェノタイピング結果(CSVファイル)
  2. 各染色体のLODスコア分布図(PDFファイル)
  3. 関連候補領域を示したBEDファイル

価格・納期

    詳細はお問い合せください。

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